L'interfaccia utente di GeoGebra consiste in una finestra grafica e una finestra algebra. Da un lato è possibile operare con il mouse, selezionando gli strumenti geometrici in dotazione per creare costruzioni geometriche sul foglio da disegno della finestra grafica.
Dall'altro è possibile digitare direttamente comandi e funzioni nel campo di inserimento, utilizzando la tastiera. La rappresentazione grafica di tutti gli oggetti viene visualizzata nella finestra grafica, mentre la rappresentazione algebrica di tali oggetti viene visualizzata nella finestra algebra.
Questo strumento consente di copiare le proprietà di visualizzazione (ad es. colore, dimensione, stile del tratto) da un oggetto ad uno o più oggetti.
Selezionare l’oggetto avente le proprietà che si desiderano copiare, quindi fare clic su tutti gli altri oggetti che devono adottare queste proprietà. 
Fare clic sull'oggetto da eliminare. 
Selezionare e trascinare gli oggetti liberi con il mouse. Selezionando un oggetto con un clic su di esso, nel modo
- … eliminare l’oggetto premendo il tasto CANC
- … muovere l’oggetto utilizzando i tasti freccia.
Selezionare e trascinare il foglio da disegno all’interno della Vista Grafica per scegliere la zona da visualizzare. 
Questo strumento consente di memorizzare nella Vista Foglio di calcolola sequenza dei valori assunti da un oggetto in movimento. È applicabile a numeri, punti e vettori. 
Selezionare due oggetti per ottenere informazioni relative alla loro relazione in una finestra separata. 
Dopo aver selezionato il centro di rotazione è possibile ruotare gli oggetti liberi attorno a tale punto, trascinandoli con il mouse. 
Fare clic su un oggetto per visualizzare o nasconderne l'etichetta. 
Dopo avere attivato questo strumento, selezionare l’oggetto da visualizzare o nascondere, quindi selezionare un altro strumento per applicare le modifiche di visualizzazione dell'oggetto. 
Fare clic in un punto qualsiasi della Vista Grafica per uno zoom avanti della costruzione. 
Fare clic in un punto qualsiasi della Vista Grafica per uno zoom indietro della costruzione
Strumenti per il processo di costruzione di una figura:
1 
Segmento AB
2 
Retta perpendicolare al segmento AB passante per B
3 
Nuovo punto C sulla retta perpendicolare
4 
Retta parallela al segmento AB passante per C
5
Retta perpendicolare al segmento AB passante per A
6 
Punto di intersezione D
7 
Poligono ABCD
8 
Circonferenza di centro A passante per B
9
Circonferenza di centro B passante per A
10
Intersecare le due circonferenze per ottenere il punto C
11
Poligono ABC in senso antiorario
12 
Nascondere le circonferenze
13 
Mostrare gli angoli interni del triangolo
ESEMPIO:
Costruzione di un quadrato:
In questa attività verranno utilizzati i seguenti strumenti.
Assicurarsi di conoscere il corretto utilizzo di ogni strumento, prima di iniziare la costruzione del quadrato:
Processo di costruzione:
1. Tracciare il segmento a = AB tra i punti A e B
2. Costruire la retta perpendicolare b al segmento AB, passante per B
3. Costruire la circonferenza c di centro B passante per il punto A
4. Intersecare la circonferenza c con la retta perpendicolare b per ottenere il punto di intersezione C
5. Costruire la retta perpendicolare d al segmento AB, passante per A
6. Costruire la circonferenza e di centro A, passante per B
7. Intersecare la retta perpendicolare d con la circonferenza e, per ottenere il punto di intersezione D
8. Creare il poligono ABCD. Suggerimento: Non dimenticare di chiudere il poligono facendo clic sul punto A, dopo avere selezionato il punto D.
9. Nascondere le circonferenze e le rette perpendicolari
10. Eseguire il test di trascinamento per verificare se la costruzione è corretta
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